交通運輸系下設汽車運用與維修、城市軌道交通車輛運用與檢修、通用航空器維修和飛行技術與航務管理四個專業。
　　汽車運用與維修專業是全國示范專業、北京市特色高水平骨干專業，北京市示范專業、北京市職業院校創新團隊、北京理工大學全國重點建設職業教育師資培訓基地。與上汽大眾汽車有限公司和華晨寶馬汽車有限公司合作，成立了在京唯一的上汽大眾SCEP和寶馬集團BEST的北京培訓基地，成立了企業品牌訂單班。建有國家一類汽車維修企業資質、示范級水平的校內生產性實訓基地，面積8150㎡，設備價值3100萬。90%以上畢業生進入高端汽車市場就業；學生就業滿意率達到95%以上。在全國職業院校技能大賽（中職組）中榮獲21個獎項。2015、2016、2017年學生謝景輝、許鶴鳴、宿昊宗連續3年獲得全國職業院校技能大賽中職組車身修復項目冠軍。
　　通用航空器維修、飛行技術與航務管理兩個專業與華彬天星通航有限公司進行校企合作，產教深度融合，推進“學培互融，育訓結合”的人才培養模式改革，建有符合國家民航局CCAR147培訓機構要求綜合訓練基地，擁有200余臺機務維修實訓設備、訓練用飛機、飛行駕駛模擬訓練器等實訓設備，可提供國家標準的機務維修培訓和相關飛行及航務管理社會培訓及科普教育活動。
　　城市軌道交通車輛運用與檢修專業建有500㎡的城市軌道交通車輛檢修綜合訓練基地，設備總值達到454萬，可開設軌道車輛模擬駕駛、地鐵車輛調度、線路檢測、屏蔽門維修等項目實訓。學生在北京市職業院校技能大賽（中職組）中榮獲7個獎項。
　　我系擁有一支優秀的教師團隊，教師全部具有中高級技術職稱，30%具有碩士研究生以上學歷，專業教師全部擁有企業實踐經歷，理論功底扎實，教學與實踐經驗豐富。
　　我系與北京工業職業技術學院、北京交通運輸職業學院、北京交通職業技術學院、比較電子科技職業學院、國家開放大學等開展合作辦學，進行五年一貫制和3+2中高職聯合培養，為學生開辟了更多發展的新途徑。